吴丹丹

时间: 2020-03-26 点击次数:



undefined

姓名:吴丹丹
学历:博士 职称:
联系电话:

电子信箱:14646@sicau.edu.cn




个人简介:

2015年和2019年在四川农业大学分别获得农学硕士和理学博士学位。2016-2018年,在德国莱布尼兹植物遗传与农作物研究所(IPK)从事染色体结构与功能研究。目前主要利用比较基因组学和分子细胞遗传学挖掘小麦族植物基因组富集型/特异性重复序列,为小麦族植物分类提供细胞遗传学探针标记。部分研究成果发表在New Phytologist, Biologia Plantarum, Methods in Molecular Biology Springer)等期刊上。



研究方向:

小麦族植物类群的系统发育关系

                                                        

                                                         
 

主要研究内容:

 

 1. 小麦族St基因组多倍化过程中结构变异

  St基因组是小麦族的基本基因组之一,参与64.7%小麦族多年生植物形成。传统的形态学手段和现代分子生物学分类方法不能很好的对含St的异源多倍体植物进行分类和系统进化研究。我们主要利用比较基因组学和分子细胞遗传学分析St基因组在多倍化过程中染色体结构变异。可用于小麦族含St基因组植物的分类和进化研究,也有利于小麦远缘杂交附加系、代换系材料中外源染色体的鉴定。


2. Y基因组的起源和探针挖掘

  Y基因组是小麦族基本基因组之一,参与50%的小麦族异源多倍体物种形成。目前,Y基因组起源存在较大争议。由于其二倍体来源未知,且与小麦族St、W、J和Xp基因组亲缘关系相近,因此,难以对含Y基因组植物进行基因组组成鉴定和进行分类学研究。我们主要结合比较基因组学和分子细胞遗传学对Y基因组探针进行开发。可用于Y基因组鉴定及含Y基因组植物的分类学研究。

主要论文

1. Alevtina Ruban, Thomas Schmutzer, Dan D. Wu, Joerg Fuchs, Anastassia Boudichevskaia, Myroslava Rubtsova, Klaus Pistrick, Michael Melzer, Axel Himmelbach, Veit Schubert, Uwe Scholz, Andreas Houben. The supernumerary B chromosomes of Aegilops speltoides undergo precise elimination in roots early in embryo development. 2020, Nature Communications, (Revised).


2. Wu D D, Ruban A, Rutten T, Zhou Y H, Houben A. Analysis of pollen grains by immunostaining and FISH in Triticeae species. In: Pradillo M, Heckmann S (Eds.): Plant Meiosis: methods and protocols. (Series: Methods in molecular biology, Vol. 2061) New York, NY: Humana Press (2020) 347-358. dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9818-0_24 978-1-4939-9817-3


3. Wu D, Ruban A, Fuchs J, Macas J, Novak P, Vaio M, Zhou Y, Houben A. Nondisjunction and unequal spindle organization accompany the drive of Aegilops speltoides B chromosomes. New Phytol. 223 (2019) 1340-1352. dx.doi.org/10.1111/nph.15875


4. D.D. Wu, L.N. Sha, C. Tang, X. Fan, Y. Wang, H.Y. Kang, H.Q. Zhang, and Y.H. Zhou. The complete chloroplast genome sequence of Pseudoroegneria libanotica, genomic features, and phylogenetic relationship with Triticeae species. BIOLOGIA PLANTARUM. 62 (2018) 231-240. DOI: 10.1007/s10535-017-0759-y


5. Chun-tao Yang, Xing Fan, Yi Wang, Li-na Sha, Hai-qin Zhang, Hou-yang Kang, Qian Chen, Dan-dan Wu & Yong-hong Zhou (2014) Karyotype studies on 12 populations of Leymus secalinus (Georgi) Tzvelev (Poaceae: Triticeae), Caryologia, 67(2014) 110-115, DOI: 10.1080/00087114.2014.931631


6. Xing Fan, Li-Na Sha, Shuang-Bin Yu, Dan-Dan Wu, Xiao-Hong Chen, Xiao-Feng Zhuo, Hai-Qin Zhang, Hou-Yang Kang, Yi Wang, You-Liang Zheng, Yong-Hong Zhou. Phylogenetic reconstruction and diversification of the Triticeae (Poaceae) based on single-copy nuclear Acc1 and Pgk1 gene data. Biochemical Systematics and Ecology. 50(2013):346-360. https://doi.org/10.1016/j.bse.2013.05.010

 

上一篇:张亚洲

下一篇:兰秀锦